The objective of this study was to determine the prevalence of antimicrobial resistance in generic Escherichia coli isolates obtained from 90 Alberta finisher swine farms. Up to 5 isolates were obtained from each of 269 pooled fecal samples and were classified as susceptible or resistant according to Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines. Of the 1322 isolates, 166 (12.6%) were susceptible to all 15 antimicrobials. No resistance to amikacin, ceftiofur, ceftriaxone, or ciprofloxacin, antimicrobials of importance in human medicine, was observed. Relatively low frequencies of resistance were observed to gentamicin (1.1%), amoxicillin/clavulanic acid (0.7%), and cefoxitin (0.7%). Higher frequencies of resistance were observed for tetracycline (78.9%), sulfisoxazole (49.9%), streptomycin (49.6%), ampicillin (30.6%), chloramphenicol (17.6%), kanamycin (10%), and trimethoprim/ sulfamethoxazole (6.4%). Among the isolates resistant to > or = 2 antimicrobial classes, 20.8%, 20.6%, 18.2%, 7.0%, 1.8%, 0.2%, and 0.2% were resistant to 2, 3, 4, 5, 6, 7, and 8 antimicrobials, respectively. The most common multidrug-resistance patterns (resistance to > or = 2 antimicrobial classes) were streptomycin-tetracycline (9.4%), streptomycin-sulfisoxazole-tetracycline (6.2%), and ampicillin-streptomycin-sulfisoxazole-tetracycline (6.1%). More clustering (higher intra-class correlation coefficients) in antimicrobial resistance was observed for isolates at the same visit than for isolates from different visits in the same farm, indicating that sampling more farms, testing fewer isolates per visits, and taking longer periods between visits may be appropriate and more efficient for a better understanding of potential shifts in resistance over time.
L’objectif de la présente étude était de déterminer la prévalence de résistance antimicrobienne chez des isolats d’Escherichia coli génériques obtenus de 90 fermes albertaines de porcs en finition. Un maximum de 5 isolats a été obtenu de chacun des 269 échantillons de pool de fèces et étaient classés comme sensible ou résistant selon les recommandations du «Clinical and Laboratory Standards Institute». Parmi les 1322 isolats, 166 (12,6 %) étaient sensibles aux 15 antimicrobiens. Aucune résistance à l’amikacine, au ceftiofur, à la ceftriaxone ou au ciprofloxacin, des antimicrobiens importants en médecine humaine, n’a été observée. Des fréquences relativement peu élevées de résistance ont été notées pour la gentamycine (1,1 %), l’amoxicilline/acide clavulanique (0,7 %) et le cefoxitin (0,7 %). Des fréquences plus élevées de résistance ont été notées pour la tétracycline (78,9 %), le sulfisoxazole (49,9 %), la streptomycine (49,6 %), l’ampicilline (30,6 %), le chloramphénicol (17,6 %), la kanamycine (10 %) et le trimethoprime/sulfaméthoxazole (6,4 %). Parmi les isolats résistants à 2 classes ou plus d’antimicrobiens, 20,8 %, 20,6 %, 18,2 %, 7,0 %, 1,8 %, 0,2 % et 0,2 % étaient résistants respectivement à 2, 3, 4, 5, 6, 7 et 8 antimicrobiens. Les patrons les plus communs de multi-résistance (résistance à 2 classes ou plus d’antimicrobien) étaient : streptomycine-tétracycline (9,4 %), streptomycine-sulfisoxazole-tétracycline (6,2 %) et ampicilline-streptomycine-sulfisoxazole-tétracycline (6,1 %). Plus de regroupements (coefficient de corrélation intra-classe plus élevé) de résistance antimicrobienne ont été observés pour les isolats provenant d’échantillons pris lors d’une même visite que pour les isolats obtenus lors de visites différentes sur la même ferme, montrant ainsi qu’il serait plus approprié et plus efficace pour mieux comprendre les changements de résistance dans le temps, d’échantillonner plus de fermes, de tester moins d’isolats par visite et d’espacer les visites.
(Traduit par Docteur Serge Messier)